Dr. Fabio Albuquerque Marchi

Sobre

Pesquisador no Centro Internacional de Pesquisa (CIPE), A.C.Camargo Cancer Center, docente do programa de pós-graduação da Fundação Antônio Prudente, A.C.Camargo Cancer Center, membro do Comitê de Ética em Pesquisa (CEP) e do grupo Data Science. Sua área de atuação inclui biologia de sistemas e bioinformática com ênfase em métodos de integração multidimensional de dados (ômicas) e inferência de redes. Também atua ativamente em projetos focados em medicina de precisão, incluindo a investigação proteogenômica de dados, modelagem molecular e inteligência artificial no rastreamento de imagens. 

Formação

Graduação em Ciências Biológicas pelo Instituto de Biosciências, IBB-UNESP, Botucatu, SP, doutorado em Bioinformática pelo Instituto de Matemática e Estatística, IME-USP, SP e pós-doutorado em oncologia pelo A.C.Camargo Cancer Center, SP.

Contato

Telefone: (11) 2189-5000 - ramal: 2980
E-mail: fabio.marchi@accamargo.org.br

Fabio Albuquerque Marchi
  • Investigação do câncer de cólon por modelagem computacional da sinalização celular e inferência de redes complexas
  • Integração multidimensional de dados
  • Modelagem molecular de proteínas
  • Inteligência artificial na investigação de características tumorais

Comprehensive Analysis of DNA Methylation and Prediction of Response to NeoadjuvantTherapy in Locally Advanced Rectal Cancer.
do Canto LM, Barros-Filho MC, Rainho CA, Marinho D, Kupper BEC, Begnami MDFS, Scapulatempo-Neto C, Havelund BM, Lindebjerg J, Marchi FA, Baumbach J, Aguiar S Jr, Rogatto SR. Cancers (Basel). 2020 Oct 22;12(11):3079. doi: 10.3390/cancers12113079.PMID: 33105711


Inflammatory Breast Cancer: Clinical Implications of Genomic Alterations and Mutational Profiling.
Faldoni FLC, Villacis RAR, Canto LM, Fonseca-Alves CE, Cury SS, Larsen SJ, Aagaard MM, Souza CP, Scapulatempo-Neto C, Osório CABT, Baumbach J, Marchi FA, Rogatto SR.
Cancers (Basel). 2020 Sep 30;12(10):2816. doi: 10.3390/cancers12102816.
PMID: 33007869

Germline Mutation in MUS81 Resulting in Impaired Protein Stability is Associated with Familial Breast and Thyroid Cancer.
Pinheiro M, Lupinacci FCS, Santiago KM, Drigo SA, Marchi FA, Fonseca-Alves CE, Andrade SCDS, Aagaard MM, Basso TR, Dos Reis MB, Villacis RAR, Roffé M, Hajj GNM, Jurisica I, Kowalski LP, Achatz MI, Rogatto SR. CANCERS (Basel). 2020 May 20;12(5):1289. doi: 10.3390/cancers12051289. PMID: 32443704

DNA Methylation-Based Method to Differentiate Malignant from Benign Thyroid Lesions.
Barros-Filho MC, Dos Reis MB, Beltrami CM, de Mello JBH, Marchi FA, Kuasne H, Drigo SA, de Andrade VP, Saieg MA, Pinto CAL, Kowalski LP, Rogatto SR. THYROID. 2019 Sep;29(9):1244-1254. doi: 10.1089/thy.2018.0458. PMID: 31328658

Locally advanced rectal cancer transcriptomic-based secretome analysis reveals novel biomarkers useful to identify patients according to neoadjuvant chemoradiotherapy response.
Canto LMD, Cury SS, Barros-Filho MC, Kupper BEC, Begnami MDFS, Scapulatempo-Neto C, Carvalho RF, Marchi FA, Olsen DA, Madsen JS, Havelund BM, Aguiar S Jr, Rogatto SR. SCIENTIFIC REPORTS. 2019 Jun 18;9(1):8702. doi: 10.1038/s41598-019-45151-w. PMID: 31213644

Loss of DNA methylation is related to increased expression of miR-21 and miR-146b in papillary thyroid carcinoma.
Ortiz IMDP, Barros-Filho MC, Dos Reis MB, Beltrami CM, Marchi FA, Kuasne H, do Canto LM, de Mello JBH, Abildgaard C, Pinto CAL, Kowalski LP, Rogatto SR. CLINICAL EPIGENETICS. 2018 Nov 20;10(1):144. doi: 10.1186/s13148-018-0579-8. PMID: 30454026

Combining discovery and targeted proteomics reveals a prognostic signature in oral cancer.
Carnielli CM, Macedo CCS, De Rossi T, Granato DC, Rivera C, Domingues RR, Pauletti BA, Yokoo S, Heberle H, Busso-Lopes AF, Cervigne NK, Sawazaki-Calone I, Meirelles GV, Marchi FA, Telles GP, Minghim R, Ribeiro ACP, Brandão TB, de Castro G Jr, González-Arriagada WA, Gomes A, Penteado F, Santos-Silva AR, Lopes MA, Rodrigues PC, Sundquist E, Salo T, da Silva SD, Alaoui-Jamali MA, Graner E, Fox JW, Coletta RD, Paes Leme AF. NATURE COMMUNICATION. 2018 Sep 5;9(1):3598. doi: 10.1038/s41467-018-05696-2. PMID: 30185791

Multidimensional integrative analysis uncovers driver candidates and biomarkers in penile carcinoma.
Marchi FA, Martins-Jr DC, Barros-Filho MC, Kuasne H, Busso-Lopes AF, Brentani HP, Trindade-Filho JCS, Guimarães GC, Faria EF, Scapulatempo-Neto C, Lopes A, Rogatto SR. SCIENTIFIC REPORTS. 2017 Jul 27;7(1):6707. doi: 10.1038/s41598-017-06659-1. PMID: 28751665

Prognostic Classifier Based on Genome-Wide DNA Methylation Profiling in Well-Differentiated Thyroid Tumors.
Bisarro Dos Reis M, Barros-Filho MC, Marchi FA, Beltrami CM, Kuasne H, Pinto CAL, Ambatipudi S, Herceg Z, Kowalski LP, Rogatto SR. J CLIN ENDOCRINOL METAB. 2017 Nov 1;102(11):4089-4099. doi: 10.1210/jc.2017-00881. PMID: 28938489

Integrated data analysis reveals potential drivers and pathways disrupted by DNA methylation in papillary thyroid carcinomas.
Beltrami CM, Dos Reis MB, Barros-Filho MC, Marchi FA, Kuasne H, Pinto CAL, Ambatipudi S, Herceg Z, Kowalski LP, Rogatto SR. CLINICAL EPIGENETICS. 2017 May 2;9:45. doi: 10.1186/s13148-017-0346-2. PMID: 28469731

Disruption of prion protein-HOP engagement impairs glioblastoma growth and cognitive decline and improves overall survival.
Lopes MH, Santos TG, Rodrigues BR, Queiroz-Hazarbassanov N, Cunha IW, Wasilewska-Sampaio AP, Costa-Silva B, Marchi FA, Bleggi-Torres LF, Sanematsu PI, Suzuki SH, Oba-Shinjo SM, Marie SK, Toulmin E, Hill AF, Martins VR. ONCOGENE. 2015 Jun;34(25):3305-14. doi: 10.1038/onc.2014.261. PMID: 25151961