Vagas abertas para Mestrado e Doutorado

Mestrado
Doutorado

O candidato ao Programa de Pós-graduação em Oncologia da Fundação Antônio Prudente poderá candidatar-se ao Programa em qualquer época do ano. As vagas abaixo buscam candidatos para a seleção, nas seguintes linhas de pesquisa:

 

Mestrado

Linha de Pesquisa: Epidemiologia e Prevenção

Orientador: Gisele Aparecida Fernandes

E-mail: gisele.fernandes@accamargo.org.br

Título do Projeto: À definir.

Área de formação do candidato de interesse: Enfermagem, biologia, farmácia, medicina, biomedicina, odontologia e áreas afins.

Carga horária: 40 horas semanais

Dedicação Exclusiva: sim

Quantidade de vagas: 1

 

Resumo do projeto:

Estudos Ecológicos de base populacional em bases secundárias. Estudos de sobrevida hospitalar (RHC) e de base populacional (RCBP).

Observação:

Embora o programa não ofereça bolsa diretamente, o candidato poderá aplicar para bolsas de mestrado disponíveis nas diferentes agências.

 

Doutorado

Linha de Pesquisa: Biologia Celular Molecular e Genética

Orientador: Glaucia Hajj

E-mail: ghajj@accamargo.org.br

Título do Projeto: Validação do perfil de RNAs diferencialmente traduzidos no glioblastoma e sua relação com aspectos clínicos e patológicos da doença.

Área de formação do candidato de interesse: biologia, biomedicina, farmácia, química.

Carga horária: 40 horas semanais

Dedicação Exclusiva: sim

Quantidade de vagas: 1

 

Resumo do projeto:

O glioblastoma (GBM) está entre os tipos tumorais mais agressivos e de menor resposta a terapias, o que requer, portanto, uma melhor compreensão sobre o comportamento deste tipo tumoral, auxiliando no desenvolvimento de novos tipos de tratamento para a doença. Atualmente, dados de expressão gênica em tumores baseiam-se na população de mRNA total. No entanto, essa abordagem fornece pouca informação sobre o proteoma celular, pois estudos mostram que somente 40% do proteoma celular pode ser explicado pela regulação transcricional. Por outro lado, a população de mRNAs ativamente traduzidos reflete, de maneira mais fidedigna a expressão proteica, sendo, dessa forma, mais próxima à real medida da expressão gênica. Nosso grupo possui um banco de dados de sequenciamento de RNA total e diferencialmente traduzido proveniente de glioblastomas humanos de 37 pacientes que separa os pacientes em 3 grupos moleculares distintos com impacto na sobrevida.

Neste projeto pretendemos determinar uma assinatura genica mínima que separa os tumores nos três grupos moleculares distintos. A expressão dos genes da assinatura será validada através de qRT-PCR e a expressão proteica será avaliada em tissue microarrays. Adicionalmente o perfil mutacional dos genes mais comumente encontrados alterados no glioblastoma será avaliado por sequenciamento e comparado ao perfil de expressão gênico e as características de cada grupo. Finalmente, culturas primarias de glioblastomas de cada grupo molecular serão tratadas com inibidores das vias sinalização mais afetadas de cada grupo e as propriedades tumorigenicas serão avaliadas.

 

Doutorado

Linha de Pesquisa: Biologia Celular Molecular e Genética

Orientador: Glaucia Hajj

E-mail: ghajj@accamargo.org.br

Título do Projeto: Avaliação de isoformas de splicing, motivos em cis e formação de neoantígenos em mRNAs preferencialmente traduzidos em glioblastoma e sua relação com aspectos clínicos e patológicos da doença.

Área de formação do candidato de interesse: biologia, biomedicina, farmacia, quimica, computacao, matematica, estatistica.

Carga horária: 40 horas semanais

Dedicação Exclusiva: sim

Quantidade de vagas: 1

 

Resumo do projeto:

O glioblastoma (GBM) está entre os tipos tumorais mais agressivos e de menor resposta a terapias, o que requer, portanto, uma melhor compreensão sobre o comportamento deste tipo tumoral, auxiliando no desenvolvimento de novos tipos de tratamento para a doença. Atualmente, dados de expressão gênica em tumores baseiam-se na população de mRNA total. No entanto, essa abordagem fornece informação limitada acerca do proteoma celular, pois estudos mostram que somente 40% do proteoma celular pode ser explicado pela regulação transcricional. Por outro lado, a população de mRNAs ativamente traduzidos reflete, de maneira mais fidedigna a expressão proteica, sendo, dessa forma, mais próxima à real medida da expressão gênica. A identificação de RNAs diferencialmente traduzidos (translatômica) se baseia no princípio da separação dos mRNAs com base em sua associação com os ribossomos (polirribossomo ou polissomo). O RNA associado aos polissomos (PolyRNA) pode ser separado bioquimicamente e identificado através de sequenciamento. Nosso grupo possui um banco de dados de sequenciamento de RNA total e PolyRNA proveniente de 37 pacientes com GBM.

Neste projeto, pretendemos explorar este banco de dados para avaliar as características dos RNAs diferencialmente traduzidos e sua relação com dados clínicos e patológicos dos pacientes. Em particular pretendemos avaliar a diversidade de transcritos diferencialmente traduzidos por meio da detecção das isoformas de splicing e sua presença no RNA total ou associado a polissomos. Por outro lado, é conhecido que sequências ou estruturas tridimensionais na molécula de de mRNA (motivos em cis) possuem um papel na regulação traducional. Deste modo, pretendemos explorar a presença de motivos em cis, como por exemplo 5’ TOP, PRTE, CERT, IRES, HRE entre outros, e sua relação com aspectos clínicos e patológicos.

Por fim, e conhecido que as células tumorais podem adquirir novas características imunogênicas decorrentes da expressão de proteínas alteradas em sua sequência denominadas neo-antígenos. A descoberta de neo-antígenos específicos do tumor é essencial para o desenvolvimento de novos tratamentos como vacinas e imunoterapia. A identificação de neoantígenos é geralmente baseada no sequenciamento do exoma completo do DNA. No entanto, sua identificação não significa que ele será de fato expresso pelo tumor. Deste modo, a presença de possíveis neo-antígenos encontrados no RNA preferencialmente traduzido pode pode levar a descoberta de alvos para o tratamento do GBM.

Data inicial do evento
Data final do evento

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